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年终盘点 | 华大科技代谢组全年回顾

共赴多组学的 华大科技BGITech
2024-11-11
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代谢组


回顾2022年,华大科技代谢组学研究始终以技术为驱动,不断攀升科研新高度。


在这一年,非靶向代谢组学、脂质组学完成多项升级,高通量靶向代谢组学、靶向代谢组学和空间代谢组学等新品持续推出代谢组学产品实现Dr. Tom系统交付及相关多组学关联分析升级等。现在,科技君带大家一起回顾2022年华大科技代谢组学成果。



1

非靶向代谢组学

BGI Tech

代谢组学研究一直存在着代谢物鉴定难、鉴定不准确这一重大挑战,对非靶向代谢组学的数据库进行扩增升级后,代谢物的鉴定数目和鉴定准确度显著提升!针对分析内容少、图形展示形式单一等问题,我们也对非靶向代谢组学、脂质组学数据图表展示、信息分析进行了升级。


升级一  数据库扩容


在现有本地库的基础上,进一步增加了重要代谢物标准品谱图

通过精筛公共数据库中的高分辨质谱图,整合到现有的代谢鉴定流程,并增加人工核验

扩增数据库后,库容提升82%、鉴定数提升率高达70%、准确度达90%


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非靶向代谢组学又双叒叕升级,代谢物鉴定质量显著提升!


升级二  信息分析升级


正负离子数据整合展示

新增代谢物表达趋势分析、Z-score分析、ROC分析、相关性分析等17项分析内容

提供热图、和弦图、网络图等多种图表展现形式

结果说明更加通俗易懂、文件命名一目了然


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全面升级 | 非靶向代谢组学、脂质组学、广泛靶向代谢组学应有尽有




2

高通量靶向代谢组学

BGI Tech

高通量靶向代谢组学产品,能够同时解决非靶向代谢组学验证难和传统靶向代谢组学检测代谢物少的问题。HM350升级到HM400后,在检测指标、定量准确性和分析智能化方面均有较大提升,可覆盖~200种肠道菌群相关代谢物,适用于临床疾病、生物医药研究。同时,我们还推出了可以绝对定量147种小分子和近500种脂质代谢物的Quant 500高通量靶向代谢组学,适用于专门针对脂质相关方向的研究。


新品一  HM400高通量靶向代谢组


一次性绝对定量400多个代谢物,~200种肠道菌群相关代谢物

衍生化处理,实现超高灵敏度和跨量级检测;

每个代谢物均有对应的高低两条标准曲线进行绝对定量,结合同位素内标进行校正;

超高通量、准确定量、高灵敏度、稳定性佳、多组学联合。


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重磅升级 | HM400,绝对定量400+小分子代谢物

为什么有人不喜欢喝奶茶,而你却戒不掉?


新品二  Quant 500高通量靶向代谢组


基于Biocrates MxP®Quant 500试剂盒的高通量靶向代谢组学产品;

一次绝对定量147种小分子及近500种脂质代谢物

覆盖范围广、定性定量准、检测通量高。


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新品发布 | Quant 500代谢组全新来袭,绝对定量630种代谢物!




3

靶向代谢组学

BGI Tech

靶向代谢组学产品能够对目标代谢物准确定量,验证非靶向代谢组学或其他组学提出的假说。与之前的15种胆汁酸靶向检测相比,今年推出的45种胆汁酸靶向检测指标更多。在植物方向,我们推出了32种植物激素靶向检测产品,覆盖7大类植物激素,可用于植物生长发育研究。


新品一  45种胆汁酸靶向检测


一次性检测45种胆汁酸,覆盖关键的初级胆汁酸及次级胆汁酸;

MRM方法、标准曲线结合内标法进行绝对定量;

LC-MS方法再优化,同分异构体精准区分;

分析方法进行严格方法学验证,确保检测准确性。


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新品发布 | 胆汁酸靶向检测重磅上新


新品二  32种植物激素靶向检测


一次性检测32种植物激素,覆盖7大类植物激素;

使用QTRAP 6500超灵敏检测平台,MRM方法结合内标法保证定量准确性;

前处理及LC-MS方法再优化,保证检测特异性。


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夏日上新 | 植物激素靶向检测重磅来袭




4

空间代谢组学

BGI Tech

传统的LC-MS技术由于对组织样本进行均浆处理,丢失了样品中代谢物的空间分布信息。空间代谢组学结合了质谱成像和代谢组学技术,将样本切片图像定义为由若干点组成的二维点阵,通过质谱扫描来连续逐点采集质谱谱图,能够直接获取化合物在生物样本中的结构、含量及空间分布信息。


提供非靶向、靶向和不同分辨率的空间代谢组学检测服务;

化合物在生物样本中的结构、含量及空间分布信息一步搞定;

具有高灵敏度、高分辨率、高检测通量特点。


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空间代谢组学 | 质谱成像+代谢组学强强联合,定性、定量、定位信息一次搞定!




5

整体代谢组学产品

BGI Tech

对于整体的代谢组学产品而言,代谢组相关多组学关联分析产品升级后,内容丰富度、结果展示、图表呈现等方面均有大幅提升,可满足不同科研工作者需求。对于筛选出的差异物质太多,又或者组间有差异但差异不显著的重要代谢物在Pathway分析中被忽略这些问题,高级分析的推出提供了很好的解决方案。为了能够对数据进行深度挖掘,代谢组学产品也实现了Dr. Tom系统交付。


升级一  关联分析及高级分析升级


代谢组+宏基因组/16S/转录组/蛋白质组关联分析产品升级后,在分析内容丰富度、结果展示、图表呈现等方面均有大幅提升

推出了基于代谢组学的全基因组关联分析(mGWAS)产品;

推出了机器学习、GSEA、WGCNA等热门分析产品。


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mGWAS | 高级信息分析上新系列(其一)

机器学习 | 高级信息分析上新系列(其二)

多组学关联分析全面升级 | 高级信息分析上新系列(其三)

找到一大堆差异代谢物/蛋白质无从下手?GSEA和WGCNA分析了解一下


升级二  代谢组上线Dr. Tom


使用Dr. Tom数据交付平台,免费赠送三次项目重分析的机会

提供结构清晰、逻辑性强的结题报告

支持自定义绘图,一键更改比较组和图片参数;

多个分析小工具助力数据挖掘


目前,Dr. Tom多组学数据挖掘系统已经实现了全部组学(单细胞、宏基因组、表观组、转录组、蛋白质组、代谢组)云交付。


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重磅上线!代谢组实现Dr. Tom云交付,多组学数据挖掘轻松搞定!




6

代表性文章

BGI Tech

在过去的一年我们参与的代谢组科研工作也百花齐放、硕果累累,多篇文章发表于SCI核心期刊,现选取两篇代表性文章与各位老师分享👇


经典案例1:

文章题目:Mendelian randomization analyses support causal relationships between blood metabolites and the gut microbiome

发表期刊:Nature Genetics(IF=41.307)

研究单位:深圳华大生命科学研究院等


华大科技提供服务:靶向代谢组学技术(包括维生素检测、类固醇激素检测、氨基酸检测等)、基因组测序、微生物测序


研究概述:

该研究首次利用孟德尔随机化分析对3,432名具有全基因组、宏基因组、人体测量学和靶向血液代谢组特征数据的中国人进行研究,通过宏基因组和代谢组关联分析确定了肠道微生物组和血液代谢物之间的58种因果关系,并复制了其中的43种,发现多项可能具有应用前景的肠道菌群与血液代谢物的相互作用。这项研究说明了人类遗传信息的价值,有助于为临床研究确定肠道微生物特征的优先级。


▶ 文章解读链接:

Nature Genetics | 超大规模队列研究揭示肠道菌群与血液代谢物之间的因果关系




经典案例2:

文章题目:Metabolomic analyses reveals new stage-specific features of the COVID-19

发表期刊:European Respiratory Journal(IF=16.671)

研究单位:广东省人民医院、广州市疾病预防控制中心等


华大科技提供服务:非靶向代谢组学技术


研究概述:

该研究招募63名COVID-19患者为发现队列,并收集临床数据。对其血清样本进行非靶向代谢组学分析,结果显示多种氨基酸、TCA循环与COVID-19疾病严重程度相关。对发现队列中59名受试者的血清进行靶向代谢组学分析,通路分析显示能量代谢紊乱,并筛选出11种差异代谢物。用验证队列(另外118名受试者)对发现队列进行验证,最终基于“发现+验证”的代谢组学研究思路筛选出4种代谢物(苹果酸、丙酮酸、瓜氨酸和谷氨酰胺)可作为COVID-19患者危险分层的潜在生物标志物。


▶ 文章解读链接:

科研遇到瓶颈?来看这篇非靶向代谢组学文章解解惑!



    

回顾2022,我们乘风破浪、坚定前行,以不懈的努力,赢得了来之不易的成绩。


新的一年,我们将不忘初心、砥砺前行,以更高质量的科研及技术服务赢得客户认可,在“共赴多组学”的征程中迈出新步伐。


供稿:翎儿

编辑:市场部


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